PyGTK, como otros conjuntos de herramientas, te proporciona maneras de invocar widgets, tales como la bandera DIALOG_MODAL que se pasa a los dialogos, que requiere una respuesta desde el usuario antes de que el resto de la aplicación continúe. En Python, como en otros lenguajes, es una buena práctica evitar el uso de elementos de interfaz modales.

En cada interacción modal la aplicación fuerza un flujo particular en el usuario y, si bien esto es en algún momento inevitable, como regla general debe evitarse, ya que la aplicación debe tratar de adaptarse al flujo de trabajo preferido por el usuario.

Un caso particularmente frecuente de esto es la solicitud de confirmación. Cada una de ellas debería correponder a un punto en el que se debería porporcionar la posibilidad de deshacer los cambios. GIMP, la aplicación para la que se desarrolló inicialmente GTk+, evita muchas operaciones que necesitarían detenerse y solicitar confirmación del usuario mediante una instrucción de deshacer que permite deshacer cualquier operación que ejecuta.